Pour les inventaires, le Parc national de la Vanoise applique les protocoles AltiChiro et Vigie-Chiro, basés sur l'amélioration des connaissances sur l'écologie et la répartition des chiroptères en montagne, et plus particulièrement en milieux ouverts d'altitude.

Vigie-Chiro, débuté en 2022, permet un suivi de long terme sur la présence et l’abondance des espèces en périphérie du cœur du Parc national et permettra d’évaluer au niveau national l’évolution des effectifs des espèces.
 

Le protocole AltiChiro est l’étude, par enregistrement acoustique, durant une nuit, sur un panel de placettes choisies judicieusement selon le type de milieux et les habitats prioritaires.

Deux passages sont effectués sur chaque site en début et fin d’été :

• 1er passage en juillet pendant la mise bas et l’élevage des jeunes.
• 2e passage en deuxième quinzaine d'août et septembre pendant la période de reproduction et de migration.

1. Les agents du Parc utilisent des détecteurs-enregistreurs disposés, pour un temps donné, dans les biotopes appropriés. Les chauves-souris sont identifiées d’après leurs émissions ultrasonores. 
2. Les séquences acoustiques sont traitées par un logiciel d’analyse automatique (Tadarida ou Sonochiro) permettant de les trier et d’identifier, pour certaines d’entre-elles, l’espèce avec un pourcentage de fiabilité affiché. Les détecteurs permettent de transcrire les ultrasons en sons audibles.
3. Un opérateur analyse ensuite à l’oreille une partie des enregistrements pour vérifier l’exactitude des identifications d’espèces. L’analyse de ces données permet de décrire le type de milieux (bois, landes, éboulis, pelouse, lac, marais…) utilisé par les chiroptères et de préciser l'écologie des espèces sur les sites prospectés. L’analyse fine des enregistrements permet aussi de préciser le type d’activité des individus : chasse, déplacement, cris sociaux…

Les études montrent que les placettes les plus basses en altitude sont aussi les plus diversifiées en espèces ou les plus activement exploitées. Ces milieux, interfaces entre zones boisées et milieux ouverts d'altitude regroupent plusieurs associations d’espèces (de basse vallée et de montagne) et d’autres, de passage.

Certaines espèces préfèrent les milieux ouverts d'altitude. On note également une forte attractivité des zones humides (tourbières et marais principalement), au même titre que les lacs et autres zones avec présence d'eau stagnante. Ces milieux sont très informatifs pour renseigner sur la diversité d'espèces présentes sur un site en zone d'altitude.